北京市“2008”环境建设指挥部办公室设6个职能部。

　　（一）秘书行政部（机关党委）
　　负责机关政务工作；负责重要会议的组织和公文处理工作；负责重要文件和会议决定事项的督查工作；负责编辑工作信息；负责机关人事、财务、后勤保障和党群工作。

　　（二）总体策划部
　　组织制订本市2008年奥运会城市运行纲要、城市奥运环境景观总体规划，组织编制年度计划；组织拟订本市城市环境景观建设和市政设施建设标准；调控城市环境景观建设和市政设施建设、环境秩序整顿治理工作进度；研究城市环境景观建设和市政设施建设、环境秩序整顿治理以及2008年奥运会期间城市运行保障工作中遇到的新情况、新问题，提出应对措施。

　　（三）城市运行部　
　　按照北京奥组委要求，组织城市运行纲要的完善和城市运行计划的编制；负责3C城市运行纲要的完善和3C城市运行计划的编制；组织编制奥运场馆外围保障运行计划和测试赛外围运行保障计划，并组织实施；督促检查城市运行纲要及计划的落实；起草城市运行方面的重要文稿和信息。

　　（四）环境建设协调部
　　组织协调本市城市环境景观建设和市政设施建设。组织开展“城中村”的改造、广告牌匾的规范、违法建筑的拆除以及主要大街、重点地区的景观建设；督促检查2008年奥运会城市运行纲要实施计划、城市环境景观建设和市政设施建设以及2008年奥运会期间城市运行保障工作的落实；负责与奥组委和国家有关部门及市政府相关部门的综合协调。

　　（五）环境秩序协调部
　　组织协调本市城市环境秩序整顿治理和市政府执法部门的综合执法。研究拟订城市环境秩序整顿治理工作方案，并组织实施；组织开展城乡结合部地区环境秩序的专项治理；组织研究行政执法中带有普遍性的问题，提出制订或修订地方性法规、政府规章和有关对策的建议；督促检查各区县“2008”环境建设分指挥部城市环境景观建设和市政设施建设、环境秩序整顿治理工作。

　　（六）宣传动员部
　　负责本市城市环境景观建设和市政设施建设、环境秩序整顿治理等工作的新闻发布和宣传报道；动员社会各界参与相关工作；指导各区县“2008”环境建设分指挥部做好宣传动员工作。